Resultados de urocultivos en adultos realizados por el laboratorio de microbiología del Hospital de Clínicas - San Lorenzo de enero del 2015 a agosto de 2016 y métodos de estudio de las infecciones urinarias disponibles en la institución / Results of urine culture in adults carried out by the microbiology laboratory of the Clinics Hospital - San Lorenzo from january 2015 to august 2016 and methods of study of urinary infections available in the institution

Introducción: Los objetivos de este trabajo son: presentar los métodos de estudio de las infecciones urinarias actualmente disponibles en el Laboratorio de Microbiología del Hospital de Clínicas y mostrar los datos de los urocultivos evaluados en forma retrospectiva. Materiales y Métodos: Para estudiar los métodos de estudio de los urocultivos disponibles en el Laboratorio hemos recurrido al archivo del Laboratorio cuyos datos fueron consecutivamente cargados en una planilla de procesamiento de datos Excel de Microsoft Office ®. Los resultados de los urocultivos fueron evaluados de enero de 2015 a agosto de 2016, en forma retrospectiva, observacional, en corte transverso, de los adultos de ambos sexos. Las muestras para urocultivo son recibidas y procesadas en el laboratorio, siguiendo pasos preestablecidos. Resultados: El microorganismo preponderante de los urocultivos fue Escherichia coli (60% de las mujeres y 32% de los varones) seguido por Klebsiella pneumoniae (19% de los varones, 14% de las mujeres). Otros microorganismos aislados fueron Candida sp., Enterococcus faecalis, Enterobacter cloacae, Pseudomona aeruginosa, Proteus mirabilis, Staphylococcus aureus, Acinetobacter baumanii. La resistencia de Escherichia Coli a nitrofurantoína fue del 6% en los varones y 1% en las mujeres. La resistencia de E.Coli a meropenen fue también escasa. En cuanto a Klebsiella pneumoniae en las mujeres, la resistencia fue del 3%. En los hombres, los antibióticos testados para Klebsiella pneumoniae mostraron una resistencia superior al 30%, con excepción del meropenem. Uropatógenos productores de betalactamas de espectro extentido (BLEE) y de carbapenemasas fueron detectados en el presente estudio. Discusión: La toma de la orina para el urocultivo se efectúa siguiendo pautas claras, emanadas del laboratorio. Con la utilización de medios actualmente disponibles en el laboratorio, es posible tipificar el género y la especie tanto de bacterias Gram negativas y positivas como de hongos. Conclusión: La estructura del Laboratorio de Microbiología ha tenido avances que permiten la identificación precisa de los gérmenes de los urocultivos, así como la prevalencia y la resistencia que presentan a ciertos antibióticos. Estos aportes son particularmente útiles para los casos de Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae debido a su alta prevalencia. También fue factible constatar la emergencia de gérmenes productores de betalactamasas de espectro extendido (BLEE) y carbapenemasas.

Introduction: The objectives of this work are: to present the methods of study of urinary infections currently available in the Laboratory of Microbiology of the Hospital de Clínicas and to show the data of the urine cultures evaluated retrospectively. Material and method: in order to study the available methods in urine cultures in the Laboratory, we have used the laboratory file whose data were consecutively loaded in an Excel data processing form of Microsoft Office ®. The results of the urine cultures were evaluated from January 2015 to August 2016, in a retrospective, observational, cross-sectional study of adults of both sexes. Samples for urine culture are received and processed in the laboratory, following pre-established steps. Results: The predominant microorganisms were Escherichia coli in 60% of women and 32%of men, Klebsiella pneumonia 19% of men and 14% of women. Other isolated organisms were Candida sp., Enterococcus faecalis, Enterobacter cloacae, Pseudomonas aeruginosa, Proteus mirabilis, Staphylococcus aureus, and Acinetobacter baumanii. Escherichia coli resistance to nitrofurantoin was seen in 6% of men and 1% of women and meropenem resistance to E. coli was also low. As for Klebsiella pneumoniae in women, resistance to meropenem was seen in 3% of cases. In men, the antibiotics tested for Klebsiella pneumoniae showed resistance greater than 30% except for meropenem. Uropathogens producing Extended-Spectrum -lactamase (ESBL ) and Carbapenemase were found. Discussion: Urine collection for urine culture is done following clear guidelines emanating from the laboratory. With the use of media currently available in the laboratory, it is possible to typify the genus and species of both Gram negative and positive bacteria as well as fungi. Conclusion: The structure of the Laboratory of Microbiology has had advances that allow the precise identification of the germs of the urine cultures, as well as the prevalence and resistance to certain antibiotics. These contributions are particularly useful for the cases of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae due to their high prevalence. It was also possible to verify the emergence of spread spectrum beta-lactamases (ESBL) and carbapenemases.

Tuberculosis infantil: estudio de tendencia en la Región Sanitaria V de la provincia de Buenos Aires, años 2000-2014 / Childhood tuberculosis: A trend analysis in Public Health Region V of the Province of Buenos Aires, 2000-2014

La prevención, el diagnóstico y el tratamiento de la Tuberculosis Infantil (TBI), no ha sido suficientemente reconocida como causa importante de enfermedad y muerte entre los 0 a 14 años. El objetivo del presente trabajo fue analizar la situación epidemiológica de la TBI en la Región Sanitaria V (RSV), provincia de Buenos Aires. Es un estudio observacional longitudinal, realizado entre el 1º de enero del 2000 y el 31 de diciembre de 2014. Se efectuó un análisis de tendencia sobre un total de 2.142 casos de Tuberculosis Infantil, calculada por regresión lineal simple y expresada como variación anual promedio (VAP). Se analizó el número de casos notificados y tasas de incidencia(TI) por 100.000 habitantes de todas las formas de TBI, TBI pulmonar (TBIP) y TBIP confirmada por bacteriología. La TBP se estudió desagregada en dos grupos de edad: 0 a 4 y 5 a 14 años. Resultados: La tasa de incidencia de TBI y la tasa de incidencia de la TBIP presentaron una tendencia neta al descenso, con una declinación mayor al 5% y similar a la TBIP entre los 0 a 4 años y entre los 5 a 14 años. En cambio, la tasa de incidencia de la TBIP confirmada del total de los casos y en los dos subgrupos, la tendencia al descenso fue mínima y no resultó estadísticamente significativa. La TB se mantiene como un riesgo de salud en la RSV, con la mayor afectación en edades jóvenes, hecho que refleja la tendencia de una transmisión reciente y que se asocia cuando no se ha logrado controlar la enfermedad (AU)

Prevention, diagnosis, and treatment of childhood tuberculosis (childhood TB) is underrecognized as an important cause of disease and death between 0 and 14 years of age. The aim of this study was to analyze the epidemiological situation of childhood TB in the Public Health Region V (PHRV), the province of Buenos Aires. In a longitudinal, observational study conducted between January 1, 2000 and December, 2014.A trend analysis was performed in a total of 2,142 cases of childhood TB, calculated by simple linear regression and expressed as average annual rate (AAR). The number of reported cases and incidence rate (IR) were calculated per 100,000 inhabitants of all forms of childhood TB, childhood lung TB, and childhood lung TB confirmed by bacteriological tests. Lung TB was assessed according to age group: 0 to 4 and 5 to 14 years. Results: IR of childhood TB and IR of childhood lung TB showed a net downward trend, with a greater than 5% decrease and similar to childhood lung TB between children between 0 and 4 years and those between 5 and 14 years of age. However, the IR of confirmed childhood lung TB of the total of cases and in the two subgroups showed a minimal downward trend and was not statistically significant. TB remains a health risk in PHRV, with a higher incidence in children, reflecting a trend of recent transmission and associated with a lack of disease control (AU)

Tuberculosis transmission of predominant genotypes of Mycobacterium tuberculosis in Northern suburbs of Buenos Aires city region / Transmisión de la tuberculosis por genotipos predominantes de Mycobacterium tuberculosis en la región Gran Buenos Aires Norte

In 2003, the incidence of tuberculosis in Argentina showed an increase compared to 2002. The severe national crisis at the end of the 90s has probably strongly contributed to this situation. The goal of this work was to estimate the extent of the spread of the most predominant Mycobacterium tuberculosis strains and to assess the spread of predominant M. tuberculosis clusters as determined by spoligotyping and IS6110 RFLP. The study involved 590 pulmonary, smear-positive TB cases receiving medical attention at health centers and hospitals in Northern Buenos Aires (NBA) suburbs, from October 2001 to December 2002. From a total of 208 clinical isolates belonging to 6 major clusters, 63 (30.2%) isolates had identical spoligotyping and IS6110 RFLP pattern. Only 22.2% were shown to have epidemiological connections with another member of their respective cluster. In these major clusters, 30.2% of the 208 TB cases studied by both molecular techniques and contact tracing could be convincingly attributable to a recently acquired infection. This knowledge may be useful to assess the clonal distribution of predominant M. tuberculosis clusters in Argentina, which may make an impact on TB control strategies.

La incidencia de la tuberculosis en Argentina mostró en 2003 un incremento en comparación con 2002. La grave crisis nacional a fines de los 90 ha probablemente contribuido en gran medida a esta situación. El objetivo del presente trabajo fue determinar la diversidad genética de aislamientos de Mycobacterium tuberculosis y el grado de dispersión de algunas cepas mayoritarias genéticamente relacionadas. El estudio involucró 590 aislamientos clínicos provenientes de muestras respiratorias con examen directo positivo, de pacientes atendidos en los hospitales y centros de salud que conforman la región Gran Buenos Aires Norte (NBA), de octubre de 2001 a diciembre de 2002. De 208 aislamientos que se encontraron en los 6 mayores clusters, 63 (30,2%) tenían patrones idénticos de spoligotyping y de IS6110 RFLP. En el 22,2% de los casos fue posible verificar la conexión epidemiológica con otro miembro del respectivo cluster. Concluimos que el 30,2% de estos agrupamientos principales pueden ser atribuidos a una infección reciente. Estos resultados pueden ser útiles para determinar la distribución clonal de los grupos predominantes de M. tuberculosis en Argentina, lo que puede impactar en las estrategias de control de la tuberculosis.

First description of Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype in Argentina

During a population-based study to genotype isolates of Mycobacterium tuberculosis from Buenos Aires Northern suburbs, we found isolates with molecular patterns related to those of the Beijing genotype. Five out of 590 (0.85

) patients had isolates with spoligopattern identical to that of the Beijing family. Since two of these isolates showed identical IS6110RFLP pattern, we found only four different patterns containing 11 to 19 bands. The isolates were obtained from young people (including a 7 years-old child) who were born in Argentina, and were living in a small area of our region. However, conventional contact tracing did not prove epidemiological linkage among them. These isolates were fully drug-susceptible to the first-line drugs. The comparison of the IS6110RFLP patterns from our isolates against a set of 19 reference Beijing patterns from the RIVM (The Netherlands) confirmed that the strains belonged to the Beijing lineage. These findings might be partially explained by the important migration phenomena occurred during the last decade. Further surveillance studies would help in the following of Beijing family strain dissemination in our community.